Santo Stefano Rotondo wurde als christliche Kirche unter Papst Simplicius (468-483) errichtet. Papst Gregor der Große gründete um 590 bei der Kirche ein Kloster, das 1450 dem ungarischen Bettelorden der Pauliner übergeben wurde.

Bedeutung für die Kollegsgemeinschaft hat Santo Stefano Rotondo als Kirche, die 1579 ebenso wie die Ländereien und der Grundbesitz des Klosters zur Fundation des Collegium Hungaricum gehörte.